Zpracování a využití biologického materiálu pro výzkumné účely od nemocných s monoklonální gamapatií - Ing. Martina Almáši, Ph.D.

Čipové technologie analyzují celogenomový profil pacientů. Buď na úrovni DNA – komparativní genomová hybridizace nebo na úrovni RNA – genové expresní profilování.

Tabulka uvádí požadavky na minimální čistotu a množství nádorové frakce buněk pro vědecké analýzy pomocí moderních výzkumných metod prováděných v rámci naší skupiny. Metodiky jsou neustále optimalizovány vzhledem k nízkému počtu buněk tak, aby byly nastaveny jednotlivé analýzy na zpracování co nejnižšího počtu buněk. Např. pro metodu fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je požadavek na minimální množství buněk 40 000 – 100 000 buněk, při výtěžku do 40 000 je proveden sort na skla (á 1000 PCs/sklo). Metoda komparativní genové hybridizace požaduje nad 150 000 buněk, metoda celogenomového expresního profilování nad 350 000 buněk. Největší požadavky na buněčnost vyžadují proteomické analýzy min. 1 mil. plazmatických buněk.