Solubilní (sérové) nádorové markery jsou vhodné zejména pro follow up nádoru, tj včasný záchyt progrese nebo recidivy nádoru, eventuelně pro monitoraci léčby. Jako prognostické a prediktivní markery se v současné době využívají zejména markery stanovované imunohistochemicky nebo metodami molekulární biologie v tkáních.
Orgánová specificita při vyšetřování jednoho izolovaného markeru je relativně nízká, proto je nutné vyšetřovat nádorové markery v pravidelných intervalech a v optimální kombinaci.
Mnohdy je opomíjeno předoperační stanovení nádorových markerů, které je nezbytným předpokladem využití markerů v úspěšné kontrole terapie.
Normální hodnota nádorového markeru nevylučuje přítomnost nádorového onemocnění (existují i generalizované karcinomy s normálními hodnotami.
Perspektivy jsou ve vyhledávání nových markerů pomocí nejmodernějších analytických metod (proteomiky, genomiky a dalších) a při volbě terapie využívání znalostí personalizované medicíny. Pro kontrolu léčby - použití cíleného markeru pro cílenou léčbu (např. VEGF pro antiangiogenní léčbu), pro diagnostiku mikrometastáz - stanovení cirkulujících nádorových buněk v periferní krvi.